دریافت توالی های پروتئینی
دریافت توالی یک پروتئین یکی از اولین قدمهایی است که هر فردی برای پیشبرد اهداف بیوانفورماتیکی و مهندسی ملکولی به آن نیاز دارد. پایگاه های اطلاعاتی و دیتابیس های گسترده ای در این زمینه موجود هستند و هر کدام اطلاعات اولیه و دو جین اطلاعات ثانویه ی قدرتمندی را به شما در این زمینه ارائه می کنند . یکی از سایت های اینترنتی پیشتاز وابسته به موسسه بیوانفورماتیک سوئیس برای اطلاعات پروتئینی وبسایت اینترنتی اکسپازی می باشد. که توسط پروفسور آموس بایروک طراحی و پیاده سازی گردید. این وبسایت یکی از پیشتازان جهانی برای اطلاعات پروتئینی می باشد. و علاوه بر اطلاعات اولیه ی موجود،ابزارهای بسیار گوناگون و متنوعی به همراه الگوریتم ها و راهکارهای متفاوتی برای تحلیل و داده پردازی اطلاعات پروتئینی توسط این موسسه در این وبسایت ارائه میگردد.
ExPASy: https://www.expasy.org
همچنین این وبسایت بررسی های اختصاصی تر روی دیگر ارائه دهندگان خدمات تحلیلی و آماری و آنالیز پروتئینی را از طریق لینک های خارجی محیا نموده است
در مقالات قبلی در مورد نحوه ی کار با پابمد و ابزارهای موجود در آن برای جستجو و کسب اطلاعات پرداختیم و حالا شما می توانید با جستجو در مقالات ، اطلاعاتی اولیه در مورد عملکرد خاص یک پروتئین مطلوب کسب نمایید. اما این کافی نیست و نیازمند آن هستیم که اطلاعات بیشتری را مرور کنیم و برویم سراغ یک مثال عملیاتی و یک توالی پروتئینی را پیدا کنیم. برای این کار به سراغ وبسایت اکسپازی می رویم. و پس از وارد نمودن لینک آن وارد صفحه ی اصلی آن می شویم.
Link: https://www.expasy.org
خب از آنجایی که تلاش در مرکز آموزش بیوانفورماتیک نصر این است که شما با مثال های عملی وارد یک فضای کاری در حوزه ی بیوانفورماتیک بشوید،بیایید با جستجوی پروتئین انسولین ببینیم چه اطلاعاتی به ما داده می شود.
در قسمت نتایج برای ما فهرستی از منابع و تعداد اطلاعاتی که در آن موجود است و همچنین نوع اطلاعاتی که در آن ذخیره سازی شده است به نمایش در می آید
از آنجایی که به دنبال اطلاعات یک توالی میگردیم،بخش مهمی که اطلاعات مورد نظر ما را دارد بخش یونی پروت می باشد.
که با کلیک بر روی آن به صفحه ی جدید و دنیایی جدید از بیوانفورماتیک و توالی های پروتئینی وارد می شویم
در این جا اطلاعاتی از کد طبقه بندی پروتئین، نام پروتئین،اسم کد شده با استاندارد وبسایت، نام ژن ،نام پروتئین و ارگانیسمی که در آن میتوان این پروتئین را یافت و در نهایت تعداد طول توالی پروتئینی را نوشته است. تبریک میگویم حالا شما یک توالی پروتئینی دارید و کافی است بر روی یکی از لینک ها کلیک کنید تا اطلاعاتی گسترده در مورد آن پروتئین را به شما بدهد.
خبر خوب
حالا شما به دنیای بیوانفورماتیک قدم برداشته اید و اولین اطلاعات یک پروژه را دارید. هدف مرکز آموزش بیوانفورماتیک نصر،شروع یک فرایند آموزشی گسترده برای پیش برد اهداف شماست و اگر در این مسیر نیازمند مشاوره بودید،کافی است از طریق واتساپ و یا بخش پشتیبانی وبسایت و یا ایمیل با ما ارتباط برقرار کنید. در اسرع وقت با شما تماس خواهیم گرفت و به شما پاسخ خواهیم داد.
مرکز آموزش بیوانفورماتیک نصر
.
.
