
مفاهیم شبکه های زیستی در سیستم بیولوژی
- هدف مهم در سیستم بیولوژی و بیوانفورماتیک این است که قادر به فهم و تغییر در مکانیسم های مولکولی زیربنایی سازوکارهای سیستم های زیستی باشیم
- اندازه گیری پاسخ های در سطح مولکولی و دیگر خروجی های سیستم های زیستی و شبکه ها
- فرموله کردن شبکه های زیستی به زبان ریاضی
- بازسازی مدل های شبکه زیستی، حاصل از داده های تجربی و یا اطلاعات پایگاه داده
- به روش محاسباتی پیش بینی می کند که یک شبکه، تحت شرایط آزمایشی جدید، چگونه رفتار می کند
- تست و آزمایش پیش بینی های محاسباتی بصورت تجربی و آزمایشگاهی
- بفهمیم در یک بیماری کدام مکانیسم های شبکه تغییر کرده است.
- طراحی “داروها، شرایط خارجی، محیط های مصنوعی و یا مولکول ها” برای ایجاد تغییرات در شبکه های زیستی
- سیستم بیولوژی مدرن از چندین نوع متفاوت از روش های اندازه گیری برای توصیف، شناسایی و مدل سازی شبکه های زیستی استفاده می کند.
- اندازگیری در هر دو مقیاس بزرگ و کوچک
- اندازه گیری با توان بالا High-throughput
- سنجش و اندازه گیری کمی و/ یا کیفی
- به جای تجزیه و تحلیل اجزاء و عناصر تکی مانند ژن ها و پروتئین ها، هدف شناخت و درک سیستم به عنوان یک مجموعه کل (رویکرد جامع) است
انواع شبکه های بیولوژیکی
شبکه های رونویسی
شبکه های سیگنالینگ
شبکه های متابولیک
شبکه های برهمکنش پروتئین – پروتئین
شبکه های دارو-تارگت
شبکه های ژن-بیماری
شبکه های عصبی
شبکه های زیست محیطی
شبکه های اپیدمیولوژیک
و …
منبع: آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو