میکرو اری×‌بیوانفورماتیک

مهارت های لازم برای تحلیل داده های بیان ژن Microarray & RNA-seq

یکی از تکنیک های پیشرفته و بسیار کاربردی که در بیان ژن مورد استفاده قرار می گیرد تکنیک های مربوط به میکرو اری می باشد که با اسفاده از چیپ های آماده و تکنیک های مرسوم انجام می گردد و در این راستا برای انجام یک مطالعه ی تخصصی مبتنی بر تکنیک های و نرم افزارهای مدرن بیوانفورماتیکی نیازمند مهارت هایی می باشد که در این جا به صورت خلاصه وار ذکر گردیده است

مفاهیم آماری مرتبط با آنالیز بیان ژن
انواع خطا، p-value، آزمونهای t، آزمون Z

• آشنایی با محیط نرم افزاری R، نحوه نصب پکیجها بر روی R، آموزش وارد کردن داده ها به R و نحوه گرفتن داده ها

• آموزش محاسبات آماری در R، آشنایی با برخی پکیجهای مرتبط مثل limma

• آنالیز داده های میکرواری، نحوه آنالیز داده های موجود در GEO و کشیدن نمودارهای مربوط مانند heatmap

• آشنایی مقدماتی با لینوکس و بایو لینوکس

• آشنایی با آنالیز داده های توالی یابی RNAseq، آموزش پکیج های و ابزار های مرتبط

• آموزش آنالیز RNAseq با وب سرور Galaxy

• غنی سازی ژنی

• آموزش Cytoscape

• رسم و تحلیل شبکه های هم بیانی

منبع: آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

شبکه ی بیوتکنولوژی نصر

error: Content is protected !!
X