Ognm
لینک دسترسی : http://ignm.ccbb.pitt.edu/GNM_Online_Calculation.htm
شبکه ی آنلاین مدل سازیGuassian محاسبات تهادلی دینامیک هر گونه ساختاری که با فرمت PDB داشته باشد را ، با استفاده از شبکه مدل Guassian ، انجام می دهد، این شبکه ی مدل سازی برای نمایش ملکول های زیستی مورد استفاده قرار می گیرد .
Andrej Sali Lab
لینک دسترسی :
http://salilab.org/our_resources.shtml
این صفحه امکان دسترسی به منابع متفاوتی برای مقایسهی ساختارهای پروتئین های مدل سازی شده و تحلیلی از آزمایشگاه Sali در دانشگاه کالیفرنیا در سانفرانسیسکو را در بر خواهد داشت .
ClusPro
لینک دسترسی : http://cluspro.bu.edu/login.php
ClusPro ی ابزار خودکار برای محاسبات اتصال دو ساختار پروتئینی با استفاده از داده های کاربر و یا فرمت PDB ثبت شده می باشد. نتیجه بر اساس لیستی از ورودی های پیچیده، منظم سازی شده به صورت خوشه ای نشان داده خواهد شد.