یکی از چالش های پیش روی دانشجویان پیش از ورود به رشته ی بیوانفورماتیک شناخت مجموعه مهارتها و دروسی است که در این رشته تدریس می گردد و در همین راستا سرفصل دروس کارشناسی ارشد رشته ی بیوانفورماتیک در این جا ذکر میگردد
معرفی اصول بیوانفورماتیک و آشنایی با اطلاعات مربوطه
آشنایی با روش‌های تحلیل داده‌ها در بیوانفورماتیک
اصول برنامه‌نویسی و بانک‌های اطلاعاتی
روش‌های آماری در بیوانفورماتیک
الگوریتم‌ها و ابزار‌های بیوانفورماتیک
جنبه‌های کاربردی بیوانفورماتیک
برنامه‌نویسی در PERL
مدل سازی مولکولی و شیمیایی انفورماتیک
شبکه ی بیوانفورماتیک نصر