تبدیل دی ان ای به پروتئین یعنی حقیقتی جاری در تمامی ابعاد زندگی سلولها،چیزی که به ما کمک می کند تا باشیم!و حالا بگذارید با هم مروری بکنیم بر روند تبدیل دی ان به پروتئین. شاید بد نباشد بدانیم از صدها هزار توالی پروتئینی که امروز در پایگاه های اطلاعاتی موجود است و کم کم با مدرسه بیوانفورماتیک نصر به سراع آن خواهیم رفت،تنها تعداد معدودی در آزمایشگاه های واقعی جداسازی و مورد مطالعه قرار گرفته است و بیشتر آن توسط علم بیوانفورماتیک توسط آنالیز توالی های دی ان ای یک موجود زنده و محاسبات و تبدیل آن به توالی پروتئینی محاسبه و ثبت گردیده است. بله بیوانفورماتیک این است!یعنی پیش بینی دقیق!
هنگامی که یک توالی ملکول دی ان ای را داریم، به همان روشی که سلول یک توالی پروتئینی را تولید می کند، با استفاده از رمز های ژنتیکی می توانیم آن را به یک توالی پروتئینی ترجمه کنید. و جالب این جاست که رمزهای ژنتیکی جهان شمول است به جز چند استثنا محدود، و این رمز راهکار حیات و طبیعت برای حل مشکل چگونگی ارتباط توالی ۴ نوکلئوتیدی به ۲۰ آمینو اسید است. و انسان برای درک راحت تر و مدیریت منابع و اطلاعات به حروف اختصاری این ملکول ها را نام گذاری نموده است. دانستن این که سلول با چه مکانیسم و عملکردی این کار را انجام می دهد. یکی از ارزنده ترین یافته های دانش شناخت حیات در دهه ۱۹۶۰ بود. حال جواب نهایی چگونگی تبدیل این دسته های منظم نوکلئوتیدی به اسید های امینه در جدول زیر آمده است . از زیست شناسی لذت ببرید و همراه با ما زیست شناسی را همچون عسل شیرین لمس کنید و بچشید
خب آماده هستید تا مرکز آموزش بیوانفورماتیک نصر وارد اولین گام های شناخت و درک بیوانفورماتیک بشویم؟ ورود شما را خوش‌آمد میگویم. برای این که بتوانیم یک توالی دی ان ای را به پروتئین تبدیل کنیم،ابتدا باید یک توالی دی ان را یافته و سپس از یک نقطه ی دلخواه شروع به خوانش توالی به صورت ۳ حرفی نماییم.و سپس با استفاده از جدول کدون هر گاه به یک سه حرفی معنا دار رسیدیم در مقابل آن سه حرف یک آمینو اسید قرار بدهیم . البته جزئیات بسیار بیشتری را در آینده با یکدیگر مرور خواهیم کرد،اما تا بدینجا می توانیم با همدیگر این فرایند را به پیش ببریم
سه مرحله ی مورد نیاز ما این است،ابتدا توالی را بخوانیم،سپس توالی را به حروف سه تایی تقسیم کنیم و بعد از آن با حروف آمینو اسیدی به اختصار آن را به پروتئین تبدیل می کنیم!
ATGGTAGAATTTAAAGCGCCACCTATTGGGATATAAG
توالی را می خوانیم تا بر آن مسلط بشویم
ATG GTA GAA TTT AAA GCG CCA CCT ATT GGG ATA TAA G
سپس توالی را به صورت دسته های سه تایی جدا می کنیم
M V E F K A P P I G I S T O P
با طبقه بندی سه تایی و مشاهده ی جدول بالا،از هر جدول آمینو اسید مربوط به هر مجموعه نوکلئوتیدی را می نویسیم و حالا پروتئین ما آماده است
اگر توالی دی ان ای به صورت صحیح از ۵ پرایم به ۳ پرایم مرتب شده باشد، شما پروتئین خود را از ناحیه ی ترمینال آمینی به سمت ترمینال کربنی به دست خواهید آورد و این به شما کمک می کند که در نهایت لازم نباشد که به جهت توالی ها فکر کنید
بیایید با هم صادق باشیم،کاری که در بالا انجام دادیم یک فرایند بسیار زمان بر و حوصله سر بر بود اما حالا کامپیوتر و بیوانفورماتیک در خدمت شما هستند تا با استفاده از راهکار های نرم افزاری توالی آمینو اسیدی حاصل از یک توالی را برای شما محاسبه و آن را به همراه دو جین تحلیل و تفسیر به سادگی و به رایگان در اختیار شما قرار دهند!و حالا شما وارد قلمرو بیوانفورماتیک شده اید
برای یادگیری بیشتر می توانید،از مجموعه خدمات مشاوره ای مرکز بیوانفورماتیک نصر کمک بگیرید و یا در رویداد های رایگان هفتگی این مجموعه مشارکت کنید . همه چیز در اختیار شماست تا به پیروزی در قلمری بیوانفورماتیک منجر بشود.
مرکز آموزش بیوانفورماتیک نصر